甲基化DNA的解析

基于CORBA法的胚胎干細(xì)胞及腦、肝臟中Nanog、Hnf4a基因的DNA甲基化解析

雖然沒(méi)有堿基序列的變化，但細(xì)胞分裂后繼承的基因功能仍發(fā)生變化的現(xiàn)象作為表觀(guān)遺傳學(xué)而為人所知。正逐漸明確了在癌等諸多疾病中，基因的表觀(guān)遺傳學(xué)異常與病態(tài)相關(guān)。

作為表觀(guān)遺傳學(xué)基因控制之一的甲基化DNA可望在病態(tài)診斷、再生醫(yī)療等中用作篩選ES細(xì)胞或iPS細(xì)胞的生物標(biāo)記物。

這是基于CORBA法的在ES細(xì)胞及腦，肝臟中Nanog，Hnf4a基因的DNA甲基化解析例。使用DNA/RNA分析用微芯片電泳裝置進(jìn)行測(cè)定。

＊CORBA：COmbined Bisulfite Restriction Analysis

凝膠圖與電泳圖

可知對(duì)于維持ES細(xì)胞多能性而言非常重要的Nanog基因在ES細(xì)胞中低甲基化，在腦中高甲基化，與肝臟特異性基因表達(dá)相關(guān)的Hnf4a基因在肝臟中低甲基化，在腦中高甲基化。

＊數(shù)據(jù)提供:東京大學(xué)大學(xué)院農(nóng)學(xué)生命科學(xué)研究所　教授鹽田邦郎先生

DNA甲基化解析還有亞硫酸氫鹽測(cè)序等若干分析方法，但本法低成本、高通量，可有效應(yīng)用于測(cè)序樣品的選擇與篩選。